由于眼睛的神经与脑神经之间的特殊关系，瞳孔的形状和大小与中枢神经的功能状态密切相关。虹膜学研究发现，瞳孔的大小、形状以及形状的变化与人体的健康状况密切相关，尤其是与脊椎和相应身体区域的神经干扰情况有关。
当脊髓的神经根受到压力，例如脊椎亚脱位时，会引发一种反射作用，使瞳孔在与受到压力的脊椎区域相对应的扇区中变平。举例来说，如果骶椎存在神经根压力，瞳孔的下方或腹侧扇区（在虹膜图上对应6点钟方向）会变平。虹膜学家可以根据瞳孔的情况判断脊椎和相应身体区域的神经干扰情况。例如，如果瞳孔在骶椎区域的6点钟位置变平，可以查看虹膜图中相邻区域以确定对应的身体部位，骶部的问题可能影响盲肠、乙状结肠、肾上腺、臀部、大腿、腿部、膝盖和脚部。胸椎区域的问题可能导致瞳孔的内侧和外侧扇区变平，而胸椎区域的紊乱可能影响心脏、支气管和肺部。颈椎和（或）枢椎区域瞳孔的变平可能反映了上脊柱的亚脱位或损伤，并影响头部、大脑、眼睛、耳朵、内耳、颈部和甲状腺。
瞳孔的变形也是虹膜学中非常重要的观察对象。椭圆形的瞳孔变形通常是严重问题的迹象，可能与脊髓液失衡、脑部和脊髓的炎症以及肿胀有关。此外，瞳孔的扁平化和扇区的变化还提供了关于脊椎刺激、损伤和亚脱位的重要线索。通过观察瞳孔扁平区域对应的脊椎区域以及虹膜图中相邻的区域，可以了解脊椎损伤对身体器官或组织的影响。
最后，虹膜学认为通过纠正身体神经根的压力，瞳孔的形状最终会恢复到正确的状态。这意味着通过调整脊椎的状态和恢复神经系统的正常功能，可以促进整体身体健康。
综上所述，瞳孔与人体健康之间存在着重要的关联。通过研究瞳孔的大小、形状和变化，虹膜学可以提供关于身体健康状况和潜在问题的信息，为健康管理和治疗提供指导。